时间:2023-05-21 01:46作者:天博app下载链接
最近,美国范德堡大学通过改良目前的蛋白质设计软件,设计并人工合成了目前为止仅次于的蛋白质,超越了华盛顿大学2003年制备的仅次于蛋白质纪录。研究人员认为,他们研发的新方法可以设计自然界没的而且更大的蛋白质,比如更加有效地的抗体和其他有益蛋白。该蛋白质称作FLR,其三维结构中有8个β链,并由8个α螺旋环绕着,排序光学小桶一样的六边形。
新的设计的蛋白质氨基酸数超过了242个,而此前的仅次于纪录是106个。过去10多年来,研究人员按照涉及的物理化学规则,利用蛋白质模型软件找到适合的氨基酸序列,拉链成平稳的形状来设计出有许多自然界没的蛋白质。但现有软件可分解上百万个候选版本,把每种氨基酸放到各个方位上测试其稳定性必须闲置大量机时,而且随着蛋白质长度减少,所须要时间不会急遽快速增长。
范德堡大学化学副教授詹斯·梅勒领导的研究团队对现有的蛋白质工程平台ROSETTA加以改进,在设计过再加了对称性。他们用于范德堡先进设备计算机研究教育中的超级计算机,花上了倒数10天时间,展开了400个处理过程来寻找最平稳的结构。
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